南京中醫(yī)藥大學比較好的專業(yè)有中醫(yī)學、中藥學、中西醫(yī)臨床醫(yī)學、護理學、藥學、康復治療學、針灸推拿學、計算機科學與技術、中藥資源與開發(fā)、公共事業(yè)管理等。
| 專業(yè)名稱 | 招生科類 | 學制 |
| 中西醫(yī)臨床醫(yī)學 | 文理兼招 | 5 |
| 中醫(yī)學（農村訂單定向醫(yī)學生免費培養(yǎng)計劃） | 文理兼招 | 5 |
| 中醫(yī)學（本博連讀） | 理科 | 9 |
| （中醫(yī)拔尖創(chuàng)新人才培養(yǎng)模式改革9年制） | ||
| 中醫(yī)學（本碩連讀） | 文理兼招 | 8 |
| （中醫(yī)拔尖創(chuàng)新人才培養(yǎng)模式改革5+3一體化） | ||
| 中醫(yī)學 | 文理兼招 | 5 |
| 中醫(yī)學（婦產科學） | 文理兼招 | 5 |
| 中醫(yī)兒科學 | 文理兼招 | 5 |
| 眼視光學 | 文理兼招 | 4 |
| 針灸推拿學 | 文理兼招 | 5 |
| 中醫(yī)養(yǎng)生學 | 文理兼招 | 5 |
| 中醫(yī)康復學 | 文理兼招 | 5 |
| 康復治療學 | 文理兼招 | 4 |
| 食品衛(wèi)生與營養(yǎng)學 | 理科 | 4 |
| 臨床醫(yī)學 | 理科 | 5 |
| 生物技術 | 理科 | 4 |
| 中藥學(本博連讀) | 理科 | 4+5 |
| （中藥學拔尖創(chuàng)新人才培養(yǎng)模式改革4+5一體化） | ||
| 中藥學類 | 理科 | 4 |
| （中藥學、中藥制藥、中藥資源與開發(fā)） | ||
| 藥學類（藥學、藥物制劑） | 理科 | 4 |
| 生物工程類(中外合作辦學) | 理科 | 3+1 |
| (生物制藥(分子生物學-藥物研制)) | ||
| 食品科學與工程類(中外合作辦學) | 理科 | 3+1 |
| (食品質量與安全) | ||
| 國際經濟與貿易 | 文理兼招 | 4 |
| 市場營銷 | 文理兼招 | 4 |
| 公共管理類 | 文理兼招 | 4 |
| （公共事業(yè)管理（衛(wèi)生事業(yè)管理）、勞動與社會保障） | ||
| 信息管理與信息系統(tǒng) | 理科 | 4 |
| 健康服務與管理 | 文理兼招 | 4 |
| 藥事管理 | 理科 | 4 |
| 電子商務 | 文理兼招 | 4 |
| 公共管理類(中外合作辦學) | 文理兼招 | 3+1 |
| 護理學 | 文理兼招 | 4 |
| 護理學（助產學） | 文理兼招 | 4 |
| 英語（只招英語考生） | 文科 | 4 |
| 計算機類 | 理科 | 4 |
| （計算機科學與技術、軟件工程） | ||
| 醫(yī)學信息工程 | 理科 | 4 |
| 應用心理學 | 文理兼招 | 4 |
南京中醫(yī)藥大學創(chuàng)建于1954年，是全國建校最早的高等中醫(yī)藥院校之一，是江蘇省人民政府與國家中醫(yī)藥管理局共建高校,學校于2017年入圍國家“雙一流”建設高校和江蘇高水平大學建設高校，2018年成為教育部和江蘇省共建“雙一流”建設高校。建校之初，學校即為新中國高等中醫(yī)藥教育培養(yǎng)輸送了第一批師資，編撰、制訂了第一套教材和教學大綱，為新中國高等中醫(yī)藥教育模式的確立和推廣作出了開創(chuàng)性貢獻，被譽為中國“高等中醫(yī)教育的搖籃”。
學校坐落于鐘靈毓秀、虎踞龍蟠的古都南京。形成了以中醫(yī)藥為主體、中西醫(yī)結合、多學科支撐協(xié)調發(fā)展的辦學格局。