專業(yè)型和學術型研究生的培養(yǎng)方向、學習內(nèi)容、學習費用和導師制度都有不同。學碩的課程設置側(cè)重于加強基礎理論的學習，重點培養(yǎng)學生從事科學研究創(chuàng)新工作的能力和素質(zhì)。專業(yè)學位課程設置以實際應用為導向，以職業(yè)需求為目標。教學內(nèi)容強調(diào)理論性與應用性課程的有機結(jié)合，突出案例分析和實踐研究。

學術型研究生主要是培養(yǎng)學術研究人才，主要重視做理論與科學研究；而專碩培養(yǎng)在某一專業(yè)(或職業(yè))領域具有堅實的基礎理論和寬廣的專業(yè)知識，具有較強的解決實際問題的能力，具有良好職業(yè)素養(yǎng)的高層次應用型專門人才?？傮w來說，學碩重理論，專碩重實踐，主要適用于企業(yè)型人才。

學術型碩士研究生的收費標準為8000元/學年，不同專業(yè)有所不同。專業(yè)碩士學費按照不同專業(yè)類別差別較大。有的學校每年2萬，有的學校每年十幾萬，不同的專業(yè)學費有所不同。但是總體來看專碩的學費要比學碩的貴。

學碩一般只有一個導師，專碩會實行雙師制。專碩在校內(nèi)的一個老師是指導學生的理論，在校外實習期間還有一個導師指導實踐。