學費不同：專碩學費高于學碩；學制不同：學碩是全日制學習，專碩是全日制學習和半脫產(chǎn)兩種形式；報考要求不同：學碩對工商管理等專業(yè)有相關(guān)工作經(jīng)驗要求，專碩對公共管理碩士等專業(yè)有相關(guān)工作經(jīng)驗要求；培養(yǎng)目標不同：專碩以專業(yè)實踐為導向，學碩以其學術(shù)研究為導向。

學費不同：學碩一年的學費為8000—10000元。專碩學費則較高，為8000——15000元。但是，學碩基本都是三年制，專碩只有兩年，因此，學費總額相差不大。

學制不同：學碩的學制是全日制學習，為3年；專碩的學制是全日制學習和半脫產(chǎn)兩種形式，學制2-3年。

報考要求不同：除了工商管理等專業(yè)之外，大多數(shù)學碩對報考者沒有工作經(jīng)驗要求，這就意味著無論是應屆生還是往屆生都可以報考。專碩個別專業(yè)如公共管理碩士等要求考生必須具備相關(guān)工作經(jīng)驗。

培養(yǎng)目標不同：專碩以專業(yè)實踐為導向，重視實踐和應用，培養(yǎng)在專業(yè)和專門技術(shù)上收到正規(guī)的、高水平訓練的高水平人才。學碩按學科設(shè)立，以其學術(shù)研究為導向，偏重理論和研究，培養(yǎng)大學教師和科研機構(gòu)研究人員。